英國《自然》雜志及其子刊27日在線發(fā)表了基因組聚集數(shù)據(jù)庫(gnomAD)團隊的系列研究論文,介紹了研究人員對這個大型數(shù)據(jù)庫的多方面分析,其結(jié)果有助人們深入認識人類基因功能,提升對罕見和常見遺傳病的理解。
基因組聚集數(shù)據(jù)庫(gnomAD)是一個大規(guī)模的人類遺傳變異體數(shù)據(jù)庫,匯集了來自不同人群的外顯子組數(shù)據(jù)和全基因組數(shù)據(jù),全球多國研究人員參與分析。研究人員將最新的分析結(jié)果匯集在7篇論文中,分別發(fā)表在《自然》《自然·通訊》及《自然·醫(yī)學(xué)》上。
研究人員在《自然》發(fā)表的一篇概述性論文中介紹,他們從125748個外顯子組和15708個全基因組測序數(shù)據(jù)中鑒定出了443769個預(yù)測的功能喪失型變異體。
同在《自然》上發(fā)表的其他論文還介紹了利用該數(shù)據(jù)庫創(chuàng)建的結(jié)構(gòu)變異資源庫,可用于評估基因缺失、復(fù)制甚至是顛倒方向等所產(chǎn)生的影響。
一些論文還探討了如何利用相關(guān)變異體評價候選藥物靶點,提升對遺傳變異體的臨床解讀等。例如,《自然·醫(yī)學(xué)》上發(fā)表的一篇論文分析了與帕金森病風(fēng)險增加相關(guān)的一個基因的變異體,結(jié)果顯示靶向這個基因可能是一種安全的治療方法。
美國布羅德研究所的丹尼爾·麥克阿瑟是gnomAD的領(lǐng)銜科學(xué)家。他在一份聲明中說,這些研究代表了這個項目的首批重要成果,這個數(shù)據(jù)庫的優(yōu)勢在于它的樣本規(guī)模以及采集人群的多樣性,這要感謝來自全球多地研究人員的貢獻。每一篇新發(fā)表的論文都代表了研究人員從一個新角度去分析這些數(shù)據(jù),從而為學(xué)界帶來新的科研資源。
盡管gnomAD數(shù)據(jù)庫取得了階段性成果,但研究人員指出,他們距離鑒定出人類全部的預(yù)測功能喪失型變異體還有很長的路要走。